La Scuola Sant'Anna partecipa attivamente a Network nazionali e internazionali costituiti assieme ad altre Università, aziende e Centri di Ricerca su temi di formazione, ricerca e Terza Missione. 
Le partnership strategiche sono invece accordi di medio/lungo termine tra enti e università su temi di interesse comune, volte a realizzare attività in ambito di: ricerca e sviluppo, innovazione, capitale umano, responsabilità sociale. L’obiettivo è potenziare il rapporto con aziende e istituzioni pubbliche e private che desiderano diventare “partner strategici” della Scuola, ossia che condividano la nostra missione e che possano collaborare non solo nell’ambito della ricerca ma anche nelle altre componenti della nostra missione. Gli accordi di partnership strategica possono permettere di finanziare anche iniziative di orientamento, summer schools, fino a posti di allievo ordinario e di PhD.