Per lo svolgimento del proprio mandato il Rettore si avvale di una Pro-Rettrice vicaria che, nei casi di impedimento o di assenza temporanei del Rettore, esercita compiti di supplenza nell’esercizio di tutte le funzioni connesse alla carica.

Il Rettore si avvale di Pro-Rettrici e Pro-Rettori, individuati tra i docenti e i ricercatori dell'Ateneo, in relazione agli obiettivi del Piano di Orientamento Strategico promosso dalla Scuola Superiore Sant’Anna.